究所、上海細胞生物學研究所、上海生理研究所、上海腦研究所、上海藥物研究所、上海植物生理研究所、上海昆蟲研究所和上海生物工程研究中心等8個生命科學研究機構經過結構調整、體制創新而組建成的。現有8個研究所和3個支撐單元，分別是生物化學與細胞生物學研究所、神經科學研究所、藥物研究所、植物生理生態研究所、健康科學研究所、營養科學研究所、上海巴斯德研究所和中科院－馬普計算生物學伙伴研究所，以及上海生命科學信息中心、上海中科伍佰豪生物工程研究發展有限公司、上海實驗動物中心。

　　上海生科院的重點研究領域主要有：功能基因組、蛋白質組和生物信息學，生物大分子的結構、相互作用及功能，細胞活動的分子網絡調控，腦發育與腦功能的分子與細胞機制研究，防治重要疾病的新藥研究開發、中藥現代化研究以及藥物研究的理論和方法，植物分子生理和植物與環境的相互作用，生物技術的創新和應用，生物醫學轉化型研究，現代營養科學研究，病毒學與免疫學研究，計算生物學研究，以及生命科學與其他學科的交叉研究。 上海生科院根據國家重大戰略需求和世界科技發展前沿，圍繞建設以人口健康與醫藥為主線的生命科學創新基地的戰略目標，將科技創新活動聚焦于生命現象本質的前沿探索和基礎研究，人口健康重大問題的轉化型研究，生物資源、農業和環境的關鍵問題等三大方向，努力在蛋白質科學和表觀遺傳調控研究、信號轉導和細胞活動分子網絡研究、腦與認知、神經系統疾病、創新藥物、干細胞、腫瘤、糖尿病機理、營養與代謝、傳染性疾病、生物質能源、轉基因作物等研究中作出重大原始創新的工作。上海生科院是在建的蛋白質科學研究南方設施項目法人單位。蛋白質科學研究南方設施的建立將提升我國生物技術高科技公司的核心競爭力，為我國打造出一個具有重大影響的*綜合性生命科學研究中心，使蛋白質科學成為創新型國家的重要標志；并帶動生命科學的整體發展和醫藥、農業、工業、環境等方面的生物技術進入先進行列。

　　承擔國家任務

　　上海生科院積極承擔國家和地方重大科研任務，共爭取到國家與地方各類科研項目（不含藥物所，以下同）989項。至2008年，共新增主持973項目7項、重大科學研究計劃項目11項、國家重大專項6項；新增主持863課題111項；新增國家自然科學基金重點項目34項、重大研究計劃23項、杰出青年基金項目29項，創新群體7項；新增中科院創新重大項目2項，重要方向性項目87項；新增上海市各類項目284項。

　　重要成果　　

上海生科院在以下領域取得了一批重大成果。

　　神經科學領域：在腦發育研究中發現了一系列調控神經生長錐轉向生長和神經細胞定向遷移的機制；在學習與記憶研究中發現果蠅跨模態學習的相互協同作用，以及果蠅蘑菇體和多巴胺系統共同掌控基于價值的抉擇；發現表達NG2膠質細胞的突觸可塑性；在神經系統疾病機理研究中發現β2-腎上腺素受體激活與老年癡呆癥的相關性，發現調控阿片受體分布及鎮痛功能的機理；等。相關成果發表于《Science》、《Nature》、《Cell》等雜志。

　　細胞信號傳導領域：在GPCR信號通路、Wnt信號通路、NF-κB信號通路、ERK信號通路的分子調控等方面取得大量研究成果。發現E2F6在紫外誘導的細胞凋亡中的作用及相關機制；發現新的ERK信號通路調控蛋白RKTG；發現β-arrestin調控Toll樣受體-白介素1體的信號轉導；發現β-arrestin1調節組蛋白乙酰化及基因轉錄的核內功能；等。相關成果發表于《Nature》系列、《Cell》及其系列等雜志。

　　表觀遺傳學領域：在這個新興的前沿研究領域取得了快速并重要的進展。發現染色質組蛋白H3K79甲基化的調控機制和在白血病發生中的作用；發現WOR1的雙穩態表達主控白念珠菌的白－灰形態轉換；發現YL1蛋白N-端dsRBD結構域對miRNA前體加工；發現新表觀遺傳控制基因；等。相關成果發表于《Cell》及其系列、《PNAS》等雜志。

　　植物分子遺傳學領域：在水稻基因組和植物功能基因組、植物的重要生理過程研究包括生殖發育、植物激素作用、代謝調控等分子機理方面以及在植物表觀遺傳學、信號傳導以及昆蟲功能基因組學、昆蟲與植物的互作等前沿領域取得了重要進展。相關成果發表于《Nature》系列、《Plant Cell》、《PNAS》等雜志。

　　腫瘤相關機理領域：在對部分腫瘤的發病機理、治療機理以及新靶點發現等研究中取得了重要進展。發現一種新的白血病腫瘤抑制基因失活的分子遺傳學機制；發現新喜樹堿衍生物NSC606985通過依賴PKC-δ的機制在納摩爾濃度誘導白血病細胞凋亡；發現磷脂酰融合酶在白血病細胞分化中起重要作用；等。相關成果發表于《Nature》系列、《Blood》等雜志。

　　免疫學研究領域：在解決免疫學基礎科學問題、改善臨床診斷治療技術和技術轉化方面都取得了重要進展，在同行中產生了重要影響。發現生物體內調節CD4+ T細胞存活和自身免疫的新機制；發現生物體內調節NK細胞殺傷活性和病毒免疫的新機制；發現生物體內調節炎癥反應的新機制；等。相關成果發表于《Nature》系列、《Blood》、《PNAS》等雜志。

　　干細胞研究領域：在胚胎干細胞自我更新和定向分化的分子研究領域取得顯著成績。建立了人的胚胎干細胞系并實現無滋養層培養，實現人胚胎干細胞向神經細胞的定向誘導分化；發現對胚胎干細胞重要轉錄因子Oct4蛋白質的新的修飾方式；發現胚胎發育早期神經干細胞維持新機制；等。相關成果發表于《Cell》系列等雜志。

　　代謝疾病領域：在導致我國肥胖、代謝綜合癥、2型糖尿病等代謝性疾病的遺傳、環境因素及其調控機理等研究中取得重要進展。發現Ufd1參與膽固醇合成調控的新機制；發現SIRT1調控胰島素敏感性；發現與糖尿病相關的葡萄糖激酶構象變化機理；等。相關成果發表于《Cell》系列、《PNAS》等雜志。

　　發表高水平論文情況

　　至2008年，上海生科院獲國家科技獎勵10項、地方科技獎勵53項、*科技獎2項。

　　2001年，生化與細胞所王恩多、王應睞、李勇、李彤、黃意巍等人完成的“氨基酰-tRNA合成酶及其與相關tRNA的相互作用”獲國家自然科學獎二等獎。

　　2002年，生化與細胞所甘人寶、李載平、黃培勇、張倩、錢悅等人完成的“重組人表皮生長因子研制及臨床應用”獲國家科技進步獎二等獎。

　　2005年，生化與細胞所劉望夷、張勁松、劉仁水、何文君、凌俊等人完成的“核糖體失活蛋白與核糖體RNA結構與功能的研究”獲國家自然科學獎二等獎。

　　2007年，生化與細胞所裴鋼、高華、程智潔、荊清等人完成的“G蛋白偶聯受體信號與其它細胞信號通路間的對話機制”獲國家自然科學獎二等獎。

　　2007年，植生生態所韓斌、馮旗、張玉軍等人完成的“水稻第四號染色體測序及功能分析”獲國家自然科學獎二等獎。

　　2008年，生化與細胞所張永蓮、陳小章、劉強、胡遠新、李鵬等人完成的“精子在附睪中成熟的分子基礎研究”獲國家自然科學獎二等獎

　　知識產權與成果轉讓

　　至2008年，上海生科院共申請發明539項，其中和外國申請57項；授權發明197項，其中外國7項；獲新藥證書7項，國家新藥臨床批件5項（生物制品*類）。

　　一批技術向國內外公司轉讓，包括基因工程酶法合成D-對羥基苯甘氨酸鄧鉀鹽技術及2項有關、高丁醇比例的微生物發酵法生產丁醇丙酮技術、“T細胞疫苗治療類風濕關節炎疾病”相關技術、與中科院上海有機化學研究所共同發明的抗艾滋病候選藥物分子（“尼非韋羅”）、人胚胎干細胞系和小鼠胚胎干細胞系技術、治療實驗性自身免疫性腦脊髓炎的兩個化合物等。